蛋白质-飞行质谱芯片技术在临床蛋白质组学研究中的能力和优势

1. 直接用粗生物样品（血清、尿、体液）进行分析
2. 同时快速发现多个生物标记物
3. 小量样品 (as few as 2000 cells for LCM samples)
4. 高通量的验证能力（with 1000s of samples a month）
5. 发现低丰度蛋白质
6. 测定疏水蛋白质: 与“双相电泳加飞行质谱”相比，除了有相似功能外，并可增加测定疏水蛋白质
7. 在同一系统中集发现和检测为一体

特异性高 利用单克隆抗体芯片，可鉴定未知抗原/蛋白质，以减少测定蛋白质序列的工作量。
可以定量 利用单克隆抗体芯片，由于结合至芯片上的抗体是定量的，故可以测定抗原量，但一般飞行质谱不用于定量分析。
功能广 I. 利用单克隆抗体芯片, 可替代 Western Blot，II. 利用单克隆抗体芯片, 可互补流式细胞仪不足的功能，如将细胞溶解，可测定细胞内的抗原, 而且灵敏度远高于流式细胞仪）。